Сейчас присоединению Протвино и Пущино препятствует закрепленный за ними статус наукограда Российской Федерации, установленный правительством. Научно-производственные комплексы городов по-прежнему соответствуют необходимым критериям из федерального законодательства, поэтому статус наукограда сохранится для Протвино до 2034 года, а для Пущино — до 2032 года. В случае присоединения к Серпухову городам помимо потери статуса наукограда грозит потеря местного самоуправления, разрушение инфраструктуры и отсутствие финансирования.
Научные сотрудники и жители Протвино и Пущино написали открытое письмо президенту России с просьбой остановить процесс присоединения к Серпухову — документ может подписать любой желающий.
